Приход в честь иконы Божией Матери «Знамение-Абалацкая» зарегистрирован в 1992 году. Первая Божественная литургия отслужена 15 ноября 1992 года. Первые богослужения и занятия в воскресной школе проходили в помещении ЖЭК, а затем в помещении бывшего детского сада.
30 сентября 1994 года рядом с детским садом Владыкой Тихоном, епископом Новосибирским и Барнаульским (ныне архиепископ Новосибирский и Бердский) освящен закладной камень, и начато строительство храма по проекту архитектора П. А. Чернобровцева.
25 июля 2000 года епископ Новосибирский и Бердский Сергий (Соколов; †2000) совершил освящение храма.
Большое участие в строительстве храма приняли: администрации области, города и района, Новосибирский завод химконцентратов (ген. директор, ныне покойный, А. И. Белосохов), ОАО «Белон» (ген. директор А. П. Добров) и другие организации.
Богослужения в храме совершаются ежедневно. По воскресным дням после окончания Литургии проводятся занятия детской и взрослой воскресных школ. В храме работает библиотека.
С 1993 года при Знаменском приходе учреждены Православная гимназия во имя святых равноапостольных Кирилла и Мефодия и детский сад. При гимназии имеется музыкальная школа. Ежегодно приход устраивает детский летний лагерь для воспитанников своих школ и детей из других приходов. Детский лагерь находится на берегу р. Обь.
Приход окормляет: колонию заключенных УФ 91/8, воспитательную колонию для несовершеннолетних, детский приемник-распределитель, детские дома №12 и в микрорайоне «Снегири», филиал Новосибирского геронтологического центра, часовню во имя святого великомученика и целителя Пантелеймона в 1-й городской клинической больнице.
